De vuelta a León en el año de 1925, cuando las leyes del gobierno sólo permitiríanejercer el ministerio a Sacerdotes Mexicanos, él decidió ejercer ocultamente su apostolado en casas de amigos. No quiso retirarse de México mientras pudiera ejercer fielmente el ministerio que sus superiores le habían encomendado, pues no debía dejar sin pastor a su Grey.

Después de dos años de ministerio, fue capturadoy apresado el Domingo de la Octava de Pascua, después de organizar una Hora Santa en la casa donde estaba refugiado. Declaró ser sacerdote y fue atormentado por los militares, el 24 de Abril fue conducido en un camión recolector de basura, al martirio, pues como era Sacerdote y había celebrado la Eucaristía, debía ser fusilado por desobediencia a las prohibiciones del gobierno. Logrando así la gracia del martirio el 25 de Abril de 1927, cerca de Lagos de Moreno Jalisco en el rancho de San Joaquín.